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                    合作交流丨中国科学院遗传与发育研究所梁承志研究员访问菲沙基因

                    发布时间:2020-1-20 15:18:32阅读次数: 分享到:

                            日前,梁承志研究员应邀来菲沙基因北京研发中心考察交流,公司总经理陈东生及北京研发中心负责人和技术骨干参与接待。


                            公司总经理陈东生就菲沙基因近年来在科研服务和临床医学中的发展向梁教授进行了介绍,他指出目前菲沙基因以三代测序、三维基因组学和表观遗传学为技术平台实现了临床科研服务,通过与各大医院进行临床重点科研合作,在肿瘤和遗传病基因组医学方向已汇集了大量的医学科研和临床资源,积累了大量的临床样本数据,正在逐渐形成“科研服务-产业化”良性循环。


                            梁老师对公司目前在医学科研方向上所做的工作给予重复肯定,并从企业技术创新的角度对公司的发展给予了指导意见,他指出目前公司的发展应利用好已经积累的大量临床样本,挖掘有效信息来揭示疾病发展规律,疾病地区分布和疾病精准预测。着重开发具备自主知识产权的产品和技术,并在此基础上,一方面加强科研创新,一方面形成标准化的生产模式。


                            双方就HERA软件的产业化应用达成共识,后续将着重在大型基因组、复杂基因组组装研究方向加强合作,加快软件测试和项目应用进程,共同推进HERE软件的集成,使之成为一个用于基因组组装的自动化软件,在基因组研究方向上产出标志性成果。


                    梁承志研究员介绍



                            梁承志,博士,研究员, 博士生导师

                            1989年毕业于武汉大学获得遗传学学士学位,1995年于中科院遗传所获得遗传学博士学位,2001在加拿大Waterloo大学获得数学与计算机科学硕士学位。2001-2012年先后在加拿大Bioinformatics Solutions Inc公司、美国纽约冷泉港实验室、菲律宾国际水稻所从事生物信息研发工作。2012年2月回国,中科院引进杰出技术人才(百人计划B类),现担任中科院遗传发育所生物大数据分析平台首席科学家。


                            主要研究领域:

                            1、基因组组装和注释。结合最新的测序技术,包括PacBio实时单分子测序、大片段测序(比如fosmid或10x Genomics)、BioNano单分子图谱,遗传图谱或Hi-C,完成基因组的组装,并利用基因表达的证据进行基因注释。

                            2、比较基因组和群体基因组分析。对水稻、小麦、苦荞、金鱼草等多个物种进行了比较基因组分析,发现了导致各个物种各自在进化上的一些关键特征的相关遗传基础。

                            3、生物信息软件和数据库开发。在基因组组装方面,开发了一个基于单分子长片段测序的组装基因组复杂区域的软件HERA,在现有软件的基础上大大提高了基因组的组装质量,也提高了分离高杂合二倍体基因组的能力。在数据库建设方面,构建了一个包括多个参考基因组、基因组注释和群体遗传多态信息,应用于功能基因组研究和分子育种的知识库。



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